為了強化國家醫療體系供應安全與藥品韌性，總統賴清德裁示暫停藥價調查3年，遭質疑是把省下來的錢補貼給藥廠。對此，衛生福利部長石崇良說，因應國際趨勢仍下調整必要藥品價格防缺藥；專利到期藥品降價照常，節省經費回歸總額，補貼國產藥，非直接投資藥廠建設。
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糖尿病是國人位居10大死因之ㄧ，糖尿病患者約有320萬人，佔健保總額支出15%，相關併發症不僅威脅民眾健康，更對健保制度帶來長期壓力。對此，健保署攜手Google台灣，結合台北醫學大學團隊與國家衛生研究院等資源，共同打造本土糖尿病風險評估模型，並於「健康存摺」APP推出個人化AI衛教助理，初步在3月底前導入全台40家診所場域驗證。
日前，國民黨團提出「兒童福利法」修法，讓0到6歲兒童健保費由國家負擔，引發討論。對此，衛福部長石崇良說明，全面補助恐違背健保「量能負擔」精神，甚至產生「越有能力者補越多」疑慮，在國家資源有限的情況下，任何一項新補助都可能排擠其他福利預算編列，必須審慎討論。
卡費可以分期付款，健保費竟也能分期付款！為了保障經濟弱勢，民眾可利用健保署的「保費分期繳納」方案，輕鬆分期繳費，減輕經濟壓力。根據統計，近3年約逾5萬人次使用，確保醫療權益不中斷；後續仍有繳納困難，欠費也不會直接列為呆帳，而是持續依法催繳，或在符合規定下移送行政執行。
2024年永豐化學爆出檢驗數據造假事件，導致生理食鹽水市場陷入供應與漲價危機，不僅衝擊醫療體系運作，也引發社會對藥品品質監管的高度關注。為防再次發生，行政院會2025年12月通過《藥事法》及《藥害救濟法》修正草案，送立法院審議，此次修法即是針對制度缺口補強，確保民眾用藥安全。
為促進民眾心理健康，衛福部推動「青壯世代心理健康支持方案」，補助15～45歲每人3次免費心理諮商，自2024年8月1日上路以來，已有超過8萬人參與、累計超過20萬人次使用。對此，衛福部宣布2026年將投入3.5億元續推「青壯世代心理健康支持方案」，除本國籍民眾，在台外籍人士只要持有健保卡也可使用。
為緩解大型醫院急診壅塞問題，衛福部11月起試辦「假日輕急症中心」，於週日或連續假日提供民眾一站式輕症醫療服務，目前上路將屆2個月。醫師工會5日表示，11月至今全國UCC每日看診人數僅約350人，運作至今成效低迷，示警實驗性政策應有終點與檢討指標，資源配置應更審慎處理。
為讓癌友獲得好的治療，台灣癌症基金會長期倡議百億癌症新藥基金，政府於2025年自公務預算挹注50億元，總統賴清德15日於基金上路一周年感恩大會指出，健保共已收載20項癌症新藥、16項擴增給付，但若立法院遲不通過年度總預算恐中斷，籲立法院以民眾福祉為念，盡快通過總預算。
