秋季是呼吸道疾病高峰期，除了流感與肺炎鏈球菌外，呼吸道融合病毒（RSV）同樣不可忽視。RSV過去被稱為「嬰幼兒呼吸道殺手」，但台灣首度針對50歲以上RSV住院患者研究發現，高齡族群重症與死亡風險極高，平均每6人就有1人病逝，重症率近3倍於流感，顯示RSV對成人亦具備高度威脅。
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2025年夏季新冠疫情高峰造成的重症人數，比10年來最嚴重的流感季還多，但台灣65歲以上長輩新冠疫苗接種率僅20.4％，僅約歐美國家的二分之一。專家指出，新冠重症死亡風險是流感還高，且恐引發全身性併發症，但最新調查指出，高風險族群疫苗猶豫比例仍高，其中以輕忽疾病與擔心疫苗副作用為2大猶豫主因。
2025年9月起，政府擴大公費HPV疫苗接種對象，國中男生首次納入施打對象，不分性別皆一起施打，這也是東亞地區首次男女一起施打公費人類乳突病毒（HPV）疫苗的行動。醫師指出，希望透過全面接種疫苗，降低HPV相關疾病（如子宮頸癌、頭頸癌）的發生率，也是癌症防治兩性平權的重要里程碑。
新冠肺炎疫情升溫，衛福部疾管署推估，疫情高峰恐落在7月初。台灣目前主流變異株為NB.1.8.1，感染科醫師指出，不少人以為新冠疫情已經結束而掉以輕心，事實上新冠病毒不會消失且持續變異，20%民眾為新冠高風險族群，若出現呼吸道症狀，應儘速篩檢是否為新冠，曾染疫而新冠再確診者，仍有重症與死亡風險，
清明連假即將到來，民眾掃墓祭祖及出遊活動將大幅增加。但衛生福利部疾病管制署提醒，侵襲性肺炎鏈球菌感染症的病例持續攀升，截至2025年3月25日已達101例確定病例，其中11例不幸死亡。感染科醫師提醒，成人公費肺炎鏈球菌疫苗自今年3月10日起擴大接種對象，呼籲19～64歲高風險族群盡速接種。
隨著時序進入春季，腸病毒好發季節即將到來。醫界人士示警，兒童殺手「腸病毒71型」恐捲土重來，新冠肺炎（COVID-19）疫情打亂腸病毒流行週期，導致台灣逾10年未流行腸病毒71型，隨時可能爆發大流行，期重症率和死亡率仍相當高，鼓勵家長帶著孩子接種疫苗獲得保護力。
藝人徐熙媛（大S）染流感猝逝，引發民眾搶打流感疫苗熱潮，造成國內疫苗庫存量缺貨，疾管署緊急增購10萬劑公費流感疫苗，在今（20）日正式開打，民眾詢問、補打意願高。但醫師提醒，高風險族群只打流感疫苗還不夠，其中約14％患者可能同時感染新冠與流感，呼籲民眾接種新冠與流感雙疫苗，降低感染重症與死亡風險。
藝人大S與家人赴日旅遊，卻不幸染流感病逝日本，引發社會大眾對流感威脅的高度關注。感染科權威、台大醫院小兒部兼任主治醫師李秉穎提醒，流感不只是普通感冒，若感染後未發燒卻出現喘不過氣的情況，是常見的重症徵兆，應立即就醫，盡快使用抗病毒藥物才是對抗流感的關鍵。
