流感疫情持續攀升，且處流感流行期。疾管署7日公布上週新增16例死亡個案，年紀最小僅5歲，發病10天就過世；然而，即便是中壯年也不容大意，另一名40多歲女性則因本身潛在肝臟疾病，導致病程發展迅速，染疫約2週過世。疾管署呼籲，建議符合公費流感及新冠疫苗接種資格民眾儘速安排接種，才能守護身體健康。
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公費流感、COVID-19疫苗1日開打啦！疾管署表示，2天已接種流感疫苗55萬劑、COVID-19疫苗16萬劑，疫苗施打數約為2024年同期3倍，推測是受藝人大S效應、流感提早流行影響。疾管署呼籲，疫情變化會跟疫苗接種狀況有關，民眾盡快接種疫苗，才能守護自我與家人的健康。
隨著新冠疫情逐漸趨於流感化，各國防疫態度也轉向與病毒共存。國衛院深入分析2020～2022年間全球34國的防疫政策，與「超額死亡」之間的關係，發現在疫情初期，政府果斷採取嚴格防控措施，防疫指標越全面的國家，有效降低傳播與死亡，對超額死亡的影響越低。其中以台灣、紐西蘭、日本、丹麥等國成果尤佳，研究成果已刊登國際知名公共衛生期刊。
流感進入流行期！衛福部疾管署表示，國內上週類流感門急診就診破11萬人次，佔急診就診病例百分比達11.5%，超過流行閾值，已進入流感流行期；至於COVID-19疫情，預估10月下旬會開始上升。疾管署呼籲民眾，符合公費流感疫苗接種者，10月1日起盡快前往施打疫苗，才能守護自身與家人的健康。
2025年夏季新冠疫情高峰造成的重症人數，比10年來最嚴重的流感季還多，但台灣65歲以上長輩新冠疫苗接種率僅20.4％，僅約歐美國家的二分之一。專家指出，新冠重症死亡風險是流感還高，且恐引發全身性併發症，但最新調查指出，高風險族群疫苗猶豫比例仍高，其中以輕忽疾病與擔心疫苗副作用為2大猶豫主因。
近年受到新冠疫情影響，加上氣候變遷等因素，流感疫情逐漸走向全年化，不再區分淡旺季。對此，醫師示警，若2025年A型流感H3N2捲土重來，強碰H1N1雙重流行，重症跟死亡風險高，免疫較弱的兒少更需警覺，鼓勵學齡前兒童、學生、65歲以上長者、高風險慢性病患者等高風險族群都該接種疫苗。
新冠肺炎（COVID-19）疫情在4月底進入流行，衛生福利部疾病管制署先前預估疫情於6月底、7月初達高峰，不過疾管署最新統計，評估疫情已提早達高峰。疾管署發言人羅一鈞表示，因民眾積極戴口罩防疫，端午連假後未見就診潮，此波疫情最新預估「跌破專家眼鏡」總就診估約42萬人次，較原預估的171萬大幅下修。
新冠肺炎疫情升溫，衛福部疾管署推估，疫情高峰恐落在7月初。台灣目前主流變異株為NB.1.8.1，感染科醫師指出，不少人以為新冠疫情已經結束而掉以輕心，事實上新冠病毒不會消失且持續變異，20%民眾為新冠高風險族群，若出現呼吸道症狀，應儘速篩檢是否為新冠，曾染疫而新冠再確診者，仍有重症與死亡風險，
